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Nature:大白血病數(shù)據(jù)庫,輔助治療藥物優(yōu)選
  • 發(fā)布日期:2018-10-19      瀏覽次數(shù):1324
    • 導讀

      歷經(jīng)多年研究,科學家們發(fā)布了一個龐大的數(shù)據(jù)集,詳細描述了500多名患有急性髓細胞性白血?。ˋcute myeloid leukemia,AML)患者腫瘤細胞的分子組成。該數(shù)據(jù)集包括數(shù)百個個體患者的細胞如何在實驗室中對一系列藥物做出反應(yīng),為日后對于AML的研究進一步打下基礎(chǔ)。

       

      DOI: doi.org/10.1038/s41586-018-0623-z

       

      10月17日,《Nature》雜志以“Functional genomic landscape of acute myeloid leukaemia”為題報道了這項研究。

       

      在美國,每年約有20,000人被診斷為AML。這種癌癥始于骨髓的造血細胞,zui常見于老年人,且在所有血癌中預后zui差。

       

      過去40年里,這種疾病的治療進展一直停滯不前,60歲以上患者的五年生存率不到10%。盡管FDA已經(jīng)批準了一些針對特定亞群患者的AML治療,患者對這些治療也有反應(yīng),但卻經(jīng)常復發(fā)。

       

      另一方面,開發(fā)有效的AML治療方法一直很有挑戰(zhàn)性,因為導致這種疾病的分子因素在患者中差異很大。研究人員已經(jīng)鑒定了至少11種AML基因,并在患者癌細胞中發(fā)現(xiàn)了成千上萬種不同的突變。

       

      遺憾的是,盡管靶向癌癥療法試圖通過利用癌細胞*的分子弱點來消除癌細胞,但該方法只針對AML具有正確分子特征的患者才有可能奏效。迄今為止,研究人員還沒有一個明確的圖譜指南來確定特定治療的zui佳方案。

       

      “雖然我們對這種白血病了解了很多,但仍然有很長的路要走。”這一研究的通訊作者、俄勒岡健康與科學大學(OHSU)研究員Brian Druker說。

       

      圖片來源:Pixabay

       

      根據(jù)Druker介紹,zui新這項研究擁有同類研究中zui大的癌癥數(shù)據(jù)集,其可以快速推進評估潛在AML治療的臨床試驗。使用一個新的在線數(shù)據(jù)查看器,研究人員現(xiàn)在可以在幾分鐘內(nèi)發(fā)現(xiàn)哪種靶向治療對特定的AML細胞亞群zui有效。“人們可以上網(wǎng)搜索我們的數(shù)據(jù)庫,并能很快找到譬如‘這是一種好藥物嗎?’或者‘我的藥物能在病人中發(fā)揮作用嗎?’等問題的相關(guān)答案。” Druker說。

       

      具體而言,這項新研究報告了BeatAML項目的初步發(fā)現(xiàn),該項目正在進入臨床試驗。Druker團隊包括11個學術(shù)醫(yī)療中心和11家制藥和生物技術(shù)公司的合作者,他們收集并分析了562名患者的672份癌細胞樣本,并評估了409個樣本的腫瘤細胞對122種不同靶向治療的反應(yīng)。

       

      “真正的力量來自于對所有數(shù)據(jù)的整合。” Druker說,“你可以分析什么藥物有效,為什么有效,這是計劃在zui有可能出現(xiàn)反應(yīng)的病人身上試驗新療法的臨床試驗的基礎(chǔ)。”

       

       

      通過描述AML患者數(shù)百份樣本的新數(shù)據(jù)集,研究人員可以了解哪些藥物對特定的患者群zui有效。該圖將ibrutinib的敏感性與腫瘤樣本中發(fā)現(xiàn)的兩種基因變化同時發(fā)生的敏感性聯(lián)系起來(來源:Nature)

       

      在他們的分析中,Druker和他的同事確定了一組三種基因突變,這些突變可能使AML患者受益于ibrutinib(FDA批準用于套細胞淋巴瘤[MCL]的靶向藥)治療。研究小組發(fā)現(xiàn),攜帶這三種突變的AML細胞對ibrutinib的敏感性明顯高于僅攜帶一兩種突變的細胞。

       

      需要指出的是,還需要臨床試驗來評估ibrutinib在這一組患者中的效果,但是將這三種突變與潛在的藥物敏感性聯(lián)系起來,展示了新數(shù)據(jù)集是如何幫助研究人員的。

       

      “當我們分析數(shù)據(jù)時,我們才剛剛觸及我們能做事情的表面。”Druker總結(jié)。

       

      責編:浮蘇

       

      參考資料:

      Vast leukemia dataset could help researchers match therapies to patients

      Functional genomic landscape of acute myeloid leukaemia

       

    魏經(jīng)理
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