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GE新平臺蛋白質實驗研究減少誤差
導讀:GE Healthcare的Amersham WB系統集成了標準化的Western blot實驗流程,包括電泳、轉印、印跡和成像分析功能,有望大大減少實驗中的差異,帶來一致的、定量的蛋白質分析結果。這臺*一體化的系統由GE Healthcare位于瑞典烏普薩拉的蛋白科學中心實驗室研發(fā),在2014年底上市。
Western blot雖然是蛋白質研究中zui常用的技術之一,但想說愛它也不容易。這是一項非常不確定的技術。有時,忙上一天,zui后什么結果也沒有。有時,結果挺好,但再也重復不了。據統計,Western blot的實驗差異性高達35-45%。這使得人們陷入了深深的憂慮:如何才能讓Western blot的結果更加一致呢?
如今,這個問題有了一個很好的答案。GE Healthcare的Amersham WB系統集成了標準化的Western blot實驗流程,包括電泳、轉印、印跡和成像分析功能,有望大大減少實驗中的差異,帶來一致的、定量的蛋白質分析結果。這臺*一體化的系統由GE Healthcare位于瑞典烏普薩拉的蛋白科學中心實驗室研發(fā),在2014年底上市。
Amersham WB由主機、軟件和專屬耗材組成。Amersham WB主機(圖1)包括兩部分:電泳掃描單元(左)和印跡單元(右)。電泳掃描單元主要負責SDS-PAGE以及凝膠或膜成像;而印跡單元則用于轉印、雜交孵育和干燥。
有了Amersham WB系統,Western blot實驗可在4小時之內完成,而無需一整天的漫長等待。無論你是開展傳統的單色分析,還是定量的雙通道分析,它都能搞定。下面我們就來看看Amersham WB系統是如何帶來一致結果的。
第1步:電泳(42分鐘)
在這一步中,電泳裝置能夠在恒定溫度下提供高度均一的電流,再加上標準化的試劑和耗材,Amersham WB系統大大提高聚丙烯酰胺凝膠電泳的一致性。Amersham WB預制膠優(yōu)化了濃縮膠和分離膠的區(qū)域,可帶來出色的分辨率;而配套的電泳緩沖液條取代了液體緩沖液,使用方便且重復性好。這些特征讓電泳步驟的變化降至zui低程度,產生了容易定量和分析的條帶。
GE Healthcare還提供了Amersham WB Cy5總蛋白標記試劑,可以很容易地預標記蛋白質,這樣在電泳后無需染色即可直接檢測總蛋白。利用Cy5總蛋白信號歸一化目標信號,可以校正上樣誤差,而無需預先定量。
第2步:轉?。?0分鐘)
從制作三明治,到蛋白質從凝膠轉移到膜上,所有關鍵的參數和組件都經過標準化,有利于帶來*的結果和zui低的背景。Amersham WB PVDF卡設計巧妙,可避免用戶誤操作,而濾紙也已經切好,配合轉印架的設計,減少出錯的可能。在關閉轉印架時,內置的滾筒可以去除氣泡,增加重現性。內置的冷卻也能保持恒定的溫度,避免過熱。
有了這一系列的措施,轉印也能夠高度重現,而不再需要擔心實驗間的差異。同時,你也不需要一次又一次地重復實驗,從而節(jié)省時間,節(jié)省經費。
第3步:雜交(155分鐘)
大家都知道,一抗很珍貴,因此都在想方設法少用一點。Amersham WB系統也能滿足你的這個愿望。系統的高靈敏度以及步驟和組件的優(yōu)化意味著你zui多能節(jié)省50%的一抗。此外,一抗也能回收,用在后續(xù)的實驗中。生物通 www.ebiotrade。。com
封閉、洗滌、一抗和二抗孵育,這些繁瑣的操作都由系統自動完成,而你所要做的只是加入一抗、二抗、封閉液和洗滌液,然后按下Start按鈕。之后,你就可以抽身去做其他的事,或者去吃飯。不放心的話,還能通過手機上的Amersham WB Watch app來遠程監(jiān)控實驗過程。
第4步:檢測和成像(15分鐘)
低熒光背景的PVDF卡,經過優(yōu)化的熒光標記試劑,以及高性能的激光掃描儀,這些帶來了高質量的定量數據。因此,你可以靈敏檢測蛋白豐度的微小變化,分離和比較磷酸化與非磷酸化蛋白,并在同一塊印跡上準確測定高豐度和低豐度蛋白。
德國癌癥研究中心的Martin Teichert談道:“因為它的動態(tài)范圍很寬,所以不再有傳統ECL的所有限制。突然,我們就能比較之前無法比較的樣品。"
第5步:分析(1-2分鐘)
對于數據分析而言,軟件的方便好用至關重要。掃描一結束,Amersham WB軟件自動開展數據分析,通過柱狀圖、泳道圖和表格顯示關鍵信息。它能顯示所選擇泳道和條帶檢測結果,定量目標蛋白相對雜質的百分比,并利用總蛋白或內參蛋白來歸一化目標蛋白的信號。在你滿意了分析結果之后,也能輕松導出這些可立即發(fā)表的圖像和數據。
此外,Amersham WB軟件也提供多種應用的標準化實驗方案,比如蛋白組成和豐度的快速篩選,比較樣品間蛋白質水平的定量分析。屏幕左側顯示正在運行的項目和參數,如有必要,可在屏幕右側修改實驗方案的默認參數。在整個Western blot過程中,大多數操作由儀器自動完成,你只需要做少量的準備工作,這個可以讓手機上的Amersham WB Watch app提醒你。
現在,你不再擔心Western blot的結果像*了吧。通過這臺智能的儀器,專屬的耗材和精心優(yōu)化的實驗方案,你可以獲得更加定量、更容易重現的Western blot數據。這樣,你就能少一些重復,少一些優(yōu)化,也少一些troubleshooting。關鍵是,對結果更有信心。
(來源:生物通)