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Western Blot,對于任何一個科研君都不陌生,但是,為甚么別人的實驗時間短、跑膠快、成像顯影辣么好看活生生的羨慕,嫉妒,hen (哼),足足被甩了幾篇SCI„內(nèi)情你知否?
除了實驗精細化操作,選擇合適的實驗試劑,還有呢?當然離不開你的優(yōu)化設(shè)計你對關(guān)鍵步驟的步步為營。
本文旨在通過提供建議,幫助您在短時間、以更少的終端用戶優(yōu)化調(diào)整得到預期結(jié)果,提升免疫印跡效果。PS:科研是不斷進步的過程,有不當之處,望指正。
何為蛋白印跡(WB)
蛋白印跡也稱作免疫印跡,是一種被廣泛應用并得到*的技術(shù),用于檢測細胞或組織提取物中的蛋白表達水平。
這一技術(shù)利用抗體與特定待檢測蛋白的結(jié)合,測定生物樣本中的蛋白水平??贵w與其靶點蛋白表位的結(jié)合可用于檢測蛋白質(zhì)中具有高度特異性的氨基酸序列。
一句話講完WB:就是抗原抗體反應!
Western Blot 可以:
1.從蛋白質(zhì)混合物中檢出目標蛋白質(zhì);
2.定量或定性確定細胞或組織中蛋白質(zhì)的表達情況;
3.用于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)-DNA、蛋白質(zhì)-RNA相互作用后續(xù)分析。
以下,會從關(guān)鍵步驟入手,我們將給出試劑和實驗過程的建議,逐一介紹每個步驟中的一些關(guān)鍵注意點以及給出對應優(yōu)化后的圖表,供大家參考
一、裂解產(chǎn)物制備 1.組織裂解
常見破碎組織的方法: 機械法、勻漿法、超聲波破碎解、研磨法,反復凍融法等;
實驗室常用的破碎方法: 1.超聲波; 2.電動研磨; 3.磁珠破碎法。(注意磁珠高速旋轉(zhuǎn)時產(chǎn)生的熱量比較多,需提前把機器放在冰箱制冷) 以上主要注意發(fā)熱引起的蛋白變性和聚集,操作過程中盡量減少細節(jié)上的差異,這樣才能保證實驗結(jié)果的重復性比較一致。
2.細胞裂解
一般裂解液包含以下幾個組分: 1. 緩沖系統(tǒng); 2. 鹽離子; 3. 離液劑;
4. 蛋白酶抑制劑; 5. 還原劑
二、凝膠電泳
1.加入足量的樣品和分子量大小標記物
SDS-PAGE 根據(jù)蛋白電泳遷移率將其分離,遷移率是蛋白大小和電荷的函數(shù)。
我們建議在預制 Tris-Glycine 小孔膠上樣20-40μg 全細胞裂解液或100ng純化蛋白,根據(jù)目標蛋白的表達量優(yōu)化上樣量。
對于大分子量靶標,我們建議采用 Tris-Acetate 凝膠和相關(guān)緩沖液。 應在待測樣本附近的泳道始終加入分子量標記物,作為參考點。 分子量標記物(或梯狀條帶)是已知分子量的純化蛋白的混合物。
采用預染色標記可以看見電泳過程中蛋白遷移的距離,隨后確認經(jīng)電轉(zhuǎn)移至膜。 采用生物素標記物可以看見膜上的梯狀條帶和抗體靶標。
2.選擇合適的蛋白marker 預染蛋白marker應用:
?實時監(jiān)控SDA-PAGE中的蛋白遷移
?檢驗western轉(zhuǎn)膜效率
?對蛋白大小進行初略鑒定
?呈彩色且轉(zhuǎn)膜效果好
三、轉(zhuǎn)膜 1.濕轉(zhuǎn)移
把蛋白從凝膠轉(zhuǎn)移至膜上的濕轉(zhuǎn)移是指把濾紙-凝膠-膜-濾紙“三明治”*浸入緩沖液中。使用此方法時,在浸沒的情況下通過電泳轉(zhuǎn)移至 0.2 μm 孔徑硝酸纖維素膜,在冷卻的含 20% 甲醇的轉(zhuǎn)移緩沖液中轉(zhuǎn)膜,70V,1.5小時。
2.半干轉(zhuǎn)移
把蛋白從凝膠轉(zhuǎn)移至膜上的半干轉(zhuǎn)移是指將浸滿緩沖液的濾紙-凝膠-膜-濾紙“三明治”系統(tǒng),置于本應干燥的陽極和陰極板上。
在這一系統(tǒng)中,轉(zhuǎn)移在桌面上進行,在室溫條件下約15-60分鐘。轉(zhuǎn)移低分子量和高分子量蛋白時這一系統(tǒng)均運轉(zhuǎn)良好,相較于濕轉(zhuǎn)移所需緩沖液更少,但是在某些情況下會產(chǎn)生更高的背景染色。(轉(zhuǎn)膜時不離人,監(jiān)測電流電壓)
3.干轉(zhuǎn)移
把蛋白從凝膠轉(zhuǎn)移至膜的干轉(zhuǎn)移是指不額外加入緩沖液的系統(tǒng),因為陽極和陰極板系統(tǒng)中含有緩沖液基質(zhì)。對于較大分子量蛋白,觀察到信號差異zui大,表明轉(zhuǎn)移效率低。
(注意:在樣本量有限或待檢測蛋白低內(nèi)源水平的情況下,干轉(zhuǎn)移方法會限制您分析的靈敏度。)
四、封閉
建議轉(zhuǎn)移之后迅速在 Tris-Buffered Saline (TBS) 中洗滌膜,以便移除殘留的轉(zhuǎn)移緩沖液,隨后在室溫條件下含5% 脫脂牛奶的 Tris Buffered Saline 和 Tween® 20 去污劑 (TBST)中封閉1小時。這一封閉步驟有助于降低非特異性一抗結(jié)合并降低背景。應避免膜封閉時間過長,因為這會掩蓋抗原表位,阻止抗體結(jié)合。封閉后在TBST 中洗滌5分鐘。
五、一抗、二抗孵育 1.加一抗與抗原結(jié)合
?一抗應在含5% BSA 或5% 脫脂牛奶的 TBST 緩沖液中稀釋。
?一抗孵育時間會有很大的差別,具體取決于研究人員采用的操作流程。建議在4℃過夜孵育一抗。(過夜孵育提高抗體結(jié)合)
?免疫印跡操作流程的另一個存在差異的方面是洗滌和稀釋緩沖液。推薦抗體稀釋緩沖液和洗滌步驟使用TBST。(TBST 緩沖液產(chǎn)生更強的信號)
2.加二抗與一抗的結(jié)合
?建議在含 5% 脫脂牛奶的 TBST 中稀釋二抗。
?因為脫脂牛奶的封閉要更強,所以基于 BSA 的稀釋比基于牛奶的稀釋產(chǎn)生的背景明顯更強。
?如果對免疫沉淀細胞裂解物進行免疫印跡實驗,考慮采用構(gòu)象或鏈特異性二抗,以避免 IgG 重鏈或輕鏈的信號。
這個步驟的成敗
關(guān)鍵看試劑質(zhì)量的好壞 用的抗體不到位 整個實驗都白費 有木有
六、檢測
一般使用辣根過氧化物酶HRP-ECL發(fā)光法或堿性磷酸酶AP-NBT/BICP顯色法。
1.HRP-ECL發(fā)光法:
將A、B發(fā)光液按比例稀釋混合。膜用去離子水稍加漂洗,濾紙貼角吸干,反貼法覆于A、B混合液滴上,熄燈至可見淡綠色熒光條帶(5min左右)后濾紙貼角吸干,置于保鮮膜內(nèi)固定于片盒中,迅速蓋上膠片,關(guān)閉膠盒,根據(jù)所見熒光強度曝光。取出膠片立即*浸入顯影液中1-2min,清水漂洗一下后放在定影液中至底片*定影,清水沖凈晾干,標定Marker,進行分析與掃描。
2.AP-NBT/BICP顯色法:
每片NBT/BICP可溶解于30ml水中,使用前將一片分裝在30個 EP管中,每張3×9cm的膜取一管配成1ml即可。將PBST或TTBS洗滌過的膜用去離子水稍加漂洗,濾紙貼角吸干,反貼法覆于NBT/BICP溶液液滴上,并用不透明物體(如報紙)遮擋光線,顯色20s后每10s觀察一次,至條帶明顯或有本底出現(xiàn)時將膜揭起置去離子水中漂洗后放濾紙上晾干即可觀察與掃描。背景深淺與一抗的質(zhì)量及二抗的量有關(guān),當然如果曝光時間長達半小時,出現(xiàn)背景是正常的。
明明白白做實驗,善其事前利其器,普通問題常規(guī)避,優(yōu)化成功沒問題